Chlor gazowy magazynowany i transportowany jest w postaci skroplonej w beczkach lub butlach a dozowanie odbywa się przy użyciu specjalnych dozatorów. Ze względów bezpieczeństwa dozowanie odbywa się przy zachowaniu zasady pełnej lub częściowej próżni (instalacja podciśnieniowa) w procesie chlorowania pośredniego (wytworzenie wody chlorowej). Wadą takiej metody dezynfekcji jest zagrożenie wycieku gazu – dlatego konieczne jest instalowanie systemu neutralizacji gazu oraz dochowywanie wysokiego reżimu transportu i składowania butli z chlorem oraz koniecznością spełnienia właściwych przepisów BHP.

Zaletą chloru gazowego jest niski koszt zakupu oraz niskie koszty instalacji.